Arrecifes

Honduras forma parte del segundo arrecife de coral más grande del mundo, puedes conocerlos desde las Islas de la Bahía.Un arrecife de coral es un tipo de arrecife biótico que se desarrolla en aguas tropicales.
Son estructuras sólidas del relieve del fondo marino formadas predominantemente por el desarrollo acumulado de corales pétreos. Aunque los corales suponen la mayor parte de la infraestructura y la masa de un arrecife de coral, los organismos más responsables en el crecimiento del arrecife contra el constante acoso de las olas oceánicas son las algas calcáreas, especies de alga roja. Los corales no realizan fotosíntesis, pero viven en una relación simbiótica con estas algas microscópicas que sí realizan la fotosíntesis, como peridinios dinoflagelados (Zooxanthellae).

Honduras también cuenta con parte de su territorio que da al Mar Caribe. No se reportan arrecifes coralinos en la costa, únicamente se han desarrollado comunidades coralinas en Puerto de Cortes, La Ceiba y Trujillo. Se hallan importantes arrecifes coralinos alrededor de Utila, Roatán y Guanaja y Cayos Cochinos entre Roatán y tierra firme. Una franja y tramos de arrecifes corren hacia el este, asociados con Misquitia y Bancos, que son una continuación del sistema de arrecifes de Nicaragua.

En la actualidad se están haciendo grandes esfuerzos para proteger los recursos marinos, los cuales se han extendido en la comunidad local, además de haber establecido recientemente una reserva marina no oficial. Hay otra áreas marinas protegidas, como la Reserva Biológica de Cayos Cochino que cubre la isla entera y el sistema de arrecifes de esta área, la cual es administrada activamente con el apoyo del sector privado.